土壤環境質量的評價所選擇評價因子一般是重金屬類毒物包括汞、鎘、鉛、銅、鉻、鎳、砷等。有機毒物有氰、酚、DDT、六六六、BaP、多氯聯苯等。也可以根據評價目的選擇評價因子。土壤環境質量評價方法上有采用生物法，即根據土壤中的生物反應評價土壤污染，比如用植物葉片、長勢和產品來判斷土壤污染狀況。也有用毒理法來評價，即根據土壤、作物、及人體攝入量的關系來評價土壤污染。