藍藻會影響水體動物的生長速度，使其出現堿中毒的現象；暴晴天時，魚苗或蝦苗會出現氣泡病然后死亡；藍藻死亡后會惡化塘底環境，出現發熱、發臭的情況。對水質檢測的作用：藍藻可作為水體污染重的指示生物，比如泥生顫藻是污水的指示生物。

1、藍藻對漁業的影響

（1）通常養殖水體中只有藍藻這1種藻類時，PH在9.0以上，直接影響水體動物的生長速度，時間久了還會出現堿中毒的現象。

（2）魚苗或蝦苗在有藍藻的水體中無法存活，在暴晴天時就會出現氣泡病然后直接死亡。

（3）藍藻有旺盛期和衰退期，衰退期的藍藻在死亡后會沉積在池塘底部，惡化池塘底部環境，出現發熱、發臭的情況。當出現蝦跳塘的現象時，就有可能是因為塘底有大量的藍藻導致蝦無法生活。

（4）水體動物吃了死亡的藍藻后，輕者出現腸炎，重者會中毒死亡，因為藍藻死后會出現經毒素、細胞內毒素和腸毒素這3種毒素，所以水體動物在攝食后才會死亡。

2、藍藻對水質檢測的作用

通常藍藻可作為水體污染重的指示生物，比如泥生顫藻為污水的指示生物，而褐色管胞藻為清水指示生物。