微生物菌肥是是根據土壤微生態學原理、植物營養學原理、以及現代“有機農業”的基本概念而研制出來的。微生物肥料是以微生物的生命活動導致作物得到特定肥料效應的一種制品，是農業生產中使用肥料的一種。其在我國已有近50年的歷史，從根瘤菌劑——細菌肥料——微生物肥料，從名稱上的演變已說明我國微生物肥料逐步發展的過程。
土壤主要由礦物質、有機質和微生物三大部分組成，土壤微生態區系的微生物的活性大小，對植物根部營養非常重要，因為土壤中的有益微生物直接參與土壤肥力的形成，包括土壤中物質和能量的轉化、腐植質的形成和分解、養分的釋放、氮素的固定等等。隨著化肥、農藥大量使用，有機肥施用量減少，土壤中有益微生物大量減少，土壤已經不再是土壤，而單一的使用化學肥料，造成土壤板結、鹽漬化日益嚴重，而微生物菌肥則是我們改善的最有效和最經濟的辦法之一。
微生物菌肥一般由以下菌種組成，而他們有什么作用呢?以下給大家普及下菌肥知識，方便大家在選購菌肥的時候作參考：
一、枯草芽孢桿菌：增加作物抗逆性、固氮。
二、巨大芽孢桿菌：解磷(磷細菌)，具有很好的降解土壤中有機磷的功效。
三、膠凍樣芽孢桿菌：解鉀，釋放出可溶磷鉀元素及鈣、硫、鎂、鐵、鋅、鉬、錳等中微量元素。
四、地衣芽孢桿菌：抗病、殺滅有害菌。
五、蘇云金芽孢桿菌：殺蟲(包括根結線蟲)，對鱗翅目等節肢動物有特異性的毒殺活性。
六、側孢芽孢桿菌：促根、殺菌及降解重金屬，
七、膠質芽孢桿菌：有溶磷、釋鉀和固氮功能，分泌多種酶，增強作物對一些病害的抵抗力。
八、涇陽鏈霉菌：具有增強土壤肥力、刺激作物生長的能力。
九、菌根真菌：擴大根系吸收面，增加對原根毛吸收范圍外的元素(特別是磷)的吸收能力。
十、棕色固氮菌：固定空氣中的游離氮，增產。
十一、光合菌群：是肥沃土壤和促進動植物生長的主力部隊。
十二、凝結芽孢桿菌：可降低環境中的氨氣、硫化氫等有害氣體。提高果實中氨基酸的含量。
十三、米曲霉：使秸稈中的有機質成為植物生長所需的營養，提高土壤有機質，改善土壤結構。
十四、淡紫擬青霉：對多種線蟲都有防治效能，是防治根結線蟲最有前途的生防制劑。
三種以上多種復合菌相互促進、相互補充，抗土傳病害效果遠遠大于單一菌種。有益菌群相互協同，共同作用，能使作物達到高產豐產的效果。金寶貝微生物菌肥是由軍科院、農科院研發，北京華夏康源科技有限公司自主投資開發策劃并組織全國市場營銷的第五代高新科技產品。正確施用本品，能使經濟作物增產30%，大田作物增產10%，降低化肥用量、降低生產成本、改良土壤結構、消除土壤板結、改善作物品質、提高商品率，最終顯著提高經濟效益，第一代老產品曾于1997年首批獲農業部微生物肥料登記證，早在1994年就獲得全國兩高一優農業新技術636f金獎、1996年中國楊陵農業科技博覽會金獎、以及后來的系列大獎，經全國二十幾個省市 自治區十多年推廣應用，效果顯著，深受廣大用戶歡迎,是國內微生物菌肥、生物肥領域的太師級產品(微生物工程技術研發始于1937)，是軍工技術農用的成功杰作。