從2014年1月1日起，未按規定安裝生活污水處理裝置的船舶，一律禁止進入蘇北運河航行、停泊和作業，嚴格控制有關危險化學品船舶在蘇北運河航行，自2013年7月1日起，中等毒性及以上的危險化學品，原則上不得從蘇北運河運輸。《江蘇省實施南水北調東線蘇北運河船舶污染防治示范工程項目實施方案》，首艘完成船舶生活污水(糞便污水)處理裝置改造試驗的“江蘇推859”的船舶生活污水(糞便污水)處理裝置安裝情況，該套裝置采用生物降解、膜微濾和紫外線消毒殺菌相結合的方法，處理船舶上各類生活污水，實現達標排放。