醫療污水主要是從醫院的診療室、化驗室、病房、洗衣房、X片照相室和手術室等排放的污水，其污水來源及成分十分復雜。醫院污水中含有大量的病原細菌、病毒和化學藥劑，具有空間污染、急性傳染和潛伏性傳染的特征。

醫院在運行過程中，不可避免地產生了具有直接或者間接感染性、毒性以及其他危害性的廢水，這些廢水的來源決定了其成分復雜性，涉及多種生物性、化學性或放射性污染。醫療廢水中除含有大量的細菌、病毒、蟲卵等致病原體外，還含有化學藥劑和放射性同位素，具有對空間污染、急性傳染和潛伏性傳染的幾大特征。如果含有病原微生物的醫療污水，不經過消毒、滅活等無害化處理，而直接排入城市下水道，往往會造成水、土壤的污染，嚴重的會引發各種疾病，或導致介水傳染病的暴發流行。