防治農(nóng)業(yè)面源污染的方法有：嚴格控制畜禽養(yǎng)殖污染、科學施用農(nóng)藥和化肥、加強無害化處理污染物力度、高度重視農(nóng)村飲用水源保護和優(yōu)化農(nóng)村生產(chǎn)生活環(huán)境。

具體防治措施如下：

（一）嚴格控制畜禽養(yǎng)殖污染。

針對全市畜禽養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展較快、污染日益嚴重的狀況，大力推行生態(tài)養(yǎng)殖模式，鼓勵對畜禽糞便實行綜合利用，做到減量化、無害化、資源化。發(fā)展養(yǎng)殖小區(qū)，實行人畜分離，引導養(yǎng)殖戶向小區(qū)聚集。根據(jù)環(huán)境的承受能力適時控制養(yǎng)殖規(guī)模，設(shè)立禁養(yǎng)區(qū)、限養(yǎng)區(qū)和非限養(yǎng)區(qū)，對新建、改建養(yǎng)殖設(shè)施實施“三同時”和排污許可制度。

（二）科學施用農(nóng)藥和化肥。

大力推廣農(nóng)作物病蟲綜合防治技術(shù)，建立安全用藥制度，推廣高效低毒低殘留農(nóng)藥，開展以蟲治蟲、以菌治菌等生物防治示范，采取誘殺等農(nóng)業(yè)防治措施，盡量減少農(nóng)藥使用量。大力推廣測土配方施肥及秸稈綜合利用技術(shù)，增加有機肥施用量，減少化肥用量，提高肥料利用率。結(jié)合農(nóng)業(yè)和農(nóng)村經(jīng)濟結(jié)構(gòu)調(diào)整，積極發(fā)展生態(tài)農(nóng)業(yè)和有機農(nóng)業(yè)，大力建設(shè)無公害農(nóng)產(chǎn)品、綠色食品、有機食品生產(chǎn)基地，加強管理，減輕農(nóng)業(yè)面源污染。

（三）加強無害化處理污染物力度。

在農(nóng)村積極推行“一池三改”，加快沼氣等可再生能源的推廣應(yīng)用。加快沼氣發(fā)電、垃圾焚燒發(fā)電工程建設(shè)，建設(shè)必要的污水和垃圾處理設(shè)施，因地制宜抓好農(nóng)村生活污水和垃圾處理，做到達標排放。

（四）高度重視農(nóng)村飲用水源保護。

加強城鎮(zhèn)和農(nóng)村人畜飲用水源地規(guī)劃建設(shè)，制定嚴格保護措施，加強飲用水源保護區(qū)管理，切實保障農(nóng)村人畜飲水安全。

（五）優(yōu)化農(nóng)村生產(chǎn)生活環(huán)境。

按照布局合理、設(shè)施配套、環(huán)境整潔、村貌美觀的原則，開展村鎮(zhèn)規(guī)劃，到2020年，基本形成中心村、中心鎮(zhèn)群落。房前、屋后和庭院栽花種草，農(nóng)戶基本都能利用沼氣和太陽能等潔凈能源。加強農(nóng)田林網(wǎng)建設(shè)，綠化村莊，提高林木覆蓋率和生態(tài)效益。