辦理新版排污許可證需提交以下材料：
1、辦理排污許可證的申請報告。
2、辦理排污許可證的申請審批表。
3、環境保護設施竣工驗收文件材料。新、改、擴建和技術改造項目要提交試生產、試運行批準文件。
4、省轄市環境監測機構出具的近6個月內的污染物排放監測報告。
5、排放口規范化整治驗收材料；應安裝污染物排放自動監控裝置的，須提交自動監控裝置的驗收材料。
6、省轄市環境保護主管部門核定的排污申報登記材料。
7、 當地政府或環境保護主管部門確定的污染物排放總量控制指標文件。
8、排污費交款通知書和“一般繳款書”回聯。 9、當地環保部門出具的核發意見和核定文件，包括各類污染物排污總量控制指標、排放濃度限值、排放去向、排污許可證發放類型等。
10、環境管理規章制度、污染防治設施運行管理規程、污染事故應急預案等環境管理材料（3、4、5、6、7、9須提交或出示一份原件）。
11、環境監察部門對該企業進行的環保治理設施日常監察材料。
12、排污許可證到期換證或進行重大事項變更的，須提交原排污許可證正副本復印件，并提交上述第1、2、4、6、7、8、10、11項材料。