1、水沖糞：水沖糞的方法是糞尿污水混合進入縫隙地板下的糞溝，每天數次從溝端的水噴頭放水沖洗。糞水順糞溝流入糞便主干溝，進入地下貯糞池或用泵抽吸到地面貯糞池。
2、水泡糞：水泡糞清糞工藝是在水沖糞工藝的基礎上改造而來的。工藝流程是在豬舍內的排糞溝中注入一定量的水，糞尿、沖洗和飼養管理用水一并排放縫隙地板下的糞溝中，儲存一定時間后（一般為1~2個月），待糞溝裝滿后，打開出口的閘門，將溝中糞水排出。糞水順糞溝流入糞便主干溝，進入地下貯糞池或用泵抽吸到地面貯糞池。
3、干清糞：干清糞工藝的主要方法是，糞便一經產生便分流，干糞由機械或人工收集、清掃、運走，尿及沖洗水則從下水道流出，分別進行處理。