一、醫療垃圾未分類會責令限期改正，給予警告并處以5000元以下的罰款，逾期不改的，處5000元以上30000以下罰款。
　　二、解釋：醫療垃圾未分類正好違反《醫療廢物管理條例》規定中的第二款未將醫療廢物按照類別分置于專用包裝物或容器的規定，所以會罰款并限期改正并給予警告。
　　三、法律依據
　　根據《醫療廢物管理條例》規定
　　第四十六條　醫療衛生機構、醫療廢物集中處置單位違反本條例規定，有下列情形之一的，由縣級以上地方人民政府衛生行政主管部門或者環境保護行政主管部門按照各自的職責責令限期改正，給予警告，可以并處5000元以下的罰款；逾期不改正的，處5000元以上3萬元以下的罰款：
　　（一）貯存設施或者設備不符合環境保護、衛生要求的；
　　（二）未將醫療廢物按照類別分置于專用包裝物或者容器的；
　　（三）未使用符合標準的專用車輛運送醫療廢物或者使用運送醫療廢物的車輛運送其他物品的；
　　（四）未安裝污染物排放在線監控裝置或者監控裝置未經常處于正常運行狀態的。

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