空氣凈化器只能循環凈化室內空氣，并不會從室外輸入新鮮空氣到室內，因此舒適度打了折扣。此外，部分空氣凈化器噪聲較大，使用時易影響人的睡眠，新風系統的噪聲相對較小。

新風系統通過通風換氣的方式向室內引入新鮮空氣，補充氧氣，能提高居室的舒適度。

而且，經過熱交換后的新鮮空氣的溫度，可調節到接近室內的溫度，即使長時間運行，室溫也不會大幅度下降。通過安裝不同的過濾網，新風系統可以過濾粉塵、花粉、PM2.5等不同污染物。

空氣凈化器適用于需要在短時間內對空氣進行凈化的居室，具有購買渠道多、無需專業施工安裝、可即插即用等優點。但遭遇長期霧霾天時，由于沒有換氣作用，空氣凈化器就有些力不能及了?？諝鈨艋髦贿m用于局部小面積內的空氣凈化。

新風系統則適用于面積較大、需要換氣卻又不方便開窗的家庭、學校、辦公樓等，但需要由專業人員來安裝，還需要架設窗機，鋪設管道，對設計、安裝的專業性要求較高。