1、申請資質(zhì)證書的單位，向本單位所在地省級環(huán)境保護(hù)行政主管部門提出申請，填報資質(zhì)證書申請表，并提交申報材料：

2、省級環(huán)境保護(hù)部門自受理申請材料之日起20個工作日內(nèi)進(jìn)行審查，提出預(yù)審意見，對符合條件的，報國家環(huán)境保護(hù)總局。

3、國家環(huán)境保護(hù)總局行政審批綜合辦公室受理經(jīng)省級環(huán)保部門初審后的材料；

4、國家環(huán)保總局科技司組織專家對企業(yè)申報材料進(jìn)行審查；

5、經(jīng)過專家審查的企業(yè)在國家環(huán)保總局網(wǎng)站公示一周；

6、國家環(huán)保總局科技司將經(jīng)公示后的材料提出意見后，報經(jīng)主管局長審批后辦理公文。

擴(kuò)展資料:

環(huán)境污染治理設(shè)施運營資質(zhì)許可管理辦法》已于2011年12月30日由環(huán)境保護(hù)部部務(wù)會議審議通過，現(xiàn)予公布，自2012年8月1日起施行。原國家環(huán)境保護(hù)總局2004年11月8日公布的《環(huán)境污染治理設(shè)施運營資質(zhì)許可管理辦法》(國家環(huán)境保護(hù)總局令第23號)同時廢止。

針對當(dāng)前脫硝設(shè)施的大規(guī)模建設(shè)以及污水處理廠污泥、農(nóng)業(yè)廢棄物等有機(jī)廢物專業(yè)化運營的出現(xiàn)，運營資質(zhì)類別在原來基礎(chǔ)上增加了有機(jī)廢物，并將除塵脫硫改為除塵脫硫脫硝。?

運營資質(zhì)等級也進(jìn)行了調(diào)整，分為甲級、乙級、臨時資質(zhì)。新《辦法》對運營資質(zhì)的等級劃分條件仍然主要考慮反映企業(yè)運營能力的企業(yè)規(guī)模、專業(yè)技術(shù)能力、運營業(yè)績等指標(biāo)。新《辦法》提高了甲級資質(zhì)的認(rèn)定條件，比如注冊資金、專業(yè)人員數(shù)量、業(yè)績規(guī)模、檢測化驗?zāi)芰Φ取?/p>

環(huán)境污染治理設(shè)施運營資質(zhì)證書辦理程序：

1、申請資質(zhì)證書的單位，向本單位所在地省級環(huán)境保護(hù)行政主管部門提出申請，填報資質(zhì)證書申請表，并提交申報材料。

2、省級環(huán)境保護(hù)部門自受理申請材料之日起20個工作日內(nèi)進(jìn)行審查，提出預(yù)審意見，對符合條件的，報國家環(huán)境保護(hù)總局。

3、國家環(huán)境保護(hù)總局行政審批綜合辦公室受理經(jīng)省級環(huán)保部門初審后的材料。

4、國家環(huán)保總局科技司組織專家對企業(yè)申報材料進(jìn)行審查。

5、經(jīng)過專家審查的企業(yè)在國家環(huán)保總局網(wǎng)站公示一周。

6、國家環(huán)保總局科技司將經(jīng)公示后的材料提出意見后，報經(jīng)主管局長審批后辦理公文。

擴(kuò)展資料：

環(huán)境污染治理設(shè)施運營資質(zhì)證書辦理所需材料：

1、環(huán)境污染治理設(shè)施運營資質(zhì)申請表（一式三份，含電子版），以下材料均提供一份。

2、法人資格證明材料（復(fù)印件）。

3、上一年度財務(wù)狀況報告或者其他資信證明。

4、技術(shù)人員專業(yè)資格證書、操作人員污染治理設(shè)施運營崗位培訓(xùn)證書和聘用合同（復(fù)印件）。

5、實驗室場所證明（或運營單位與專門檢測機(jī)構(gòu)簽訂有技術(shù)合作協(xié)議承擔(dān)運營單位的檢測任務(wù)的，可視為具備實驗室條件）。

6、預(yù)防和處理污染事故的方案。

7、規(guī)范化運營質(zhì)量保證體系有關(guān)管理制度。

8、環(huán)境污染治理設(shè)施運營實例，包括運營項目簡介、運營合同、用戶意見、環(huán)境保護(hù)監(jiān)測機(jī)構(gòu)出具的設(shè)施運行排放情況監(jiān)測報告。申請臨時資質(zhì)證書的除外。

9、申請增項和升級的單位，應(yīng)提交上年度縣級（或地、市）環(huán)保部門出具的守法證明。

參考資料來源：中國政府網(wǎng)-如何辦理環(huán)境保護(hù)設(shè)施專門運營單位資質(zhì)認(rèn)定？

參考資料來源：百度百科-環(huán)境污染治理設(shè)施運營資質(zhì)許可管理辦法