新版GMP要求，需對環(huán)境及不同階段產品監(jiān)控的微生物進行鑒定，并建立污染菌種庫，便于對日常監(jiān)測中出現(xiàn)異常菌株與菌種庫進行比對，查找其來源，以便采取有效措施。

通常，潔凈區(qū)里典型的污染菌主要來自：

人體表面：革蘭氏陽性球菌為主；

其次是環(huán)境：革蘭氏陽性桿菌為主；

各種水源：革蘭氏陰性桿菌為主的微生物。

污染來源舉例如下：

1、當潔凈區(qū)檢出菌庫的類別以革蘭氏陽性球菌屬為主的情況下，如果符合比例，表明潔凈室繼續(xù)在正常范圍內起作用，不必過分擔憂。

2、潔凈區(qū)檢出菌中，皮膚相關的微生物最常見，微球菌屬和葡萄球菌屬占50%以上，第二個最常見的屬是芽孢桿菌屬約占13%。

雖然革蘭氏陽性微生物在潔凈室中普遍存在，但其實對于葡萄球菌和微球菌屬，許多物種是人類身上固有的微生物。應注意調查此部分微生物的被采集者，加強培訓，提高人員的無菌意識，規(guī)范人員更衣程序和潔凈區(qū)行為。

3、微球菌屬中藤黃微球菌檢出率最高，它是藥物環(huán)境監(jiān)測中最常見的微生物之一。通常與人體皮膚有關，尤其是與頭部，手臂和腿部有關。無菌技術的缺陷以及潔凈室管理不善是藤黃微球菌污染的常見原因。

4、芽孢桿菌屬中蠟狀芽孢桿菌檢出率最高，蠟狀芽孢桿菌的孢子通常被確定為最難消毒和根除的。根據(jù)檢出地點，應引起足夠重視。

5、丙酸桿菌和棒狀菌毋庸置疑來自于人體。

但當某短時間在高級別潔凈室中頻繁檢出如人表皮葡萄球菌屬、丙酸桿菌屬等來自于人體的微生物，應注意生產過程中，規(guī)范人員更衣程序和潔凈區(qū)行為。或者評估所穿潔凈服的過濾能力，潔凈服由于反復滅菌使用，并無法保證所有重復使用的潔凈服都具有相同的過濾性能。

6、革蘭氏陽性桿出現(xiàn)在物體表面的頻率更高。

與 AB級潔凈區(qū)相比，CD級潔凈室中，革蘭氏陽性桿的數(shù)量相對較高。這符合正常現(xiàn)象，因為物品進入低級潔凈室的清潔消毒程序往往較不嚴格。

7、潔凈區(qū)中革蘭氏陰性桿菌和真菌的檢出率較低。但意味更深遠。應引起特別重視。

8、潔凈區(qū)中革蘭氏陰性桿菌的比例指示水源污染程度。

在D級潔凈室中，革蘭氏陰性桿菌占分離物的比例要大得多。這也反映了在這些地區(qū)水槽（水源）較多。

若在A B級潔凈室中革蘭氏陰性桿菌的比例較高，應引起重視。可能與潔凈室濕度設置過高有關，或部分水漬未及時清理擦干，也存在制藥用水過濾除菌不夠徹底的可能。企業(yè)可以實行無水化管理。

9、在檢出菌的鑒別中，葡萄球菌的不同種屬的鑒定可能挖掘不出太多有用的信息；但在B級潔凈室中鑒別到假單胞菌樣則意味著很多，務必需要擴大調查。

10、絕大多數(shù)來自潔凈區(qū)的細菌是中溫好氧或兼性需氧菌。但在使用特殊氣體，有時與冷凍干燥機相關聯(lián)的情況下，部分細菌可在厭氧條件下生長和被發(fā)現(xiàn)。

如痤瘡丙酸桿菌可能在凍干制品中被發(fā)現(xiàn)，因為本菌為厭氧或兼性厭氧，是無菌灌封中令人頭痛的一個微生物《2010GMP實施指南：無菌制劑》，根據(jù)經驗，該微生物直到在培養(yǎng)基中培養(yǎng)12 天后才能生長到肉眼可以觀察的濃度。

11、芽孢污染是制藥企業(yè)車間較為嚴重的污染之一，應注意每月交替更換消毒劑，使用殺孢子劑定期殺滅芽孢。

12、潔凈區(qū)中真菌的檢出率也很低。如果真菌的發(fā)生率較高，鑒于真菌的生長特性，反映了一些潔凈室的濕度較高或者通風不良。

特別每年梅雨季節(jié)時，空氣濕度大，真菌可能快速生長繁殖，如果物品傳遞、脫包消毒程序不夠完善，未經處理的外氣流流入或者物品和人員可能攜帶微生物帶入潔凈區(qū)。潔凈室一旦有大量真菌污染，采用紫外消毒或消毒液不易殺滅，以致無菌保障水平得到嚴重破壞，應當重視潔凈區(qū)真菌污染。

13、無菌測試結果為陽性時，檢出菌應當鑒定到種。