基層醫療機構與其他醫療機構一樣，是通過具有當地衛健委認定的 并且發給資責證書的專業單位處理醫療廢物的。

醫療廢物，是指醫療衛生機構在醫療、預防、保健以及其他相關活動中產生的具有直接或者間接感染性、毒性以及其他危害性的廢物。

醫療廢物處置費如何入賬

醫療廢物處置費，可以與其他清潔清理費用一起合并計入“管理費用--衛生費”科目

借：管理費用--衛生費

貸：銀行存款

收費標準?　?。?）有固定病床的醫療機構按實際使用床位數2.80元/床?日計收；　?。?）街、鄉、鎮衛生院、專業診療機構按營業額0.5%計收；?　?。?）個體診所、社區衛生服務站、單位衛生室、各類門診部按在職醫務人員40元/人?月計收；?　?。?）計量征收標準為3.50元/公斤。?　　考慮到不同醫療機構醫療廢物產生量不同，允許處置單位和醫療機構在規定標準內協商確定具體收費標準。收費前雙方應簽訂處置服務協議，明確各自的職責與權利。?

為了處置廢物所發生的支出，應當計入經營費用，或者醫療支出進行核算。借：管理費用/經營費用-醫療廢物處置費 貸：庫存現金/銀行存款非企業制醫療單位，可參考事業單位核算辦法進行核算。借：經營支出--醫療廢物處置費 貸：庫存現金/銀行存款