不知你是代表哪一方。監理？業主?承包商？各自利益不同，處理要求自然不同。
根據FIDIC的原則（我國的施工合同范本也是參照FIDIC來的），如果因業主原因導致工期延長，承包商可以索賠。索賠的內容包括：EOT（延長工期），延期部分的直接費用增加，增加的管理費（包括總部管理費），延期階段的應得利潤，延期部分的物價上漲，延期部分的保險費，保函手續費，融資成本等。
如果延期階段項目已暫停施工超過90天，承包商可以要求終止合同，進行項目清算。清算內容如下：已完工作的應得款項，未完工作估價并要求業主支付，為本項目采購的專用設備材料的剩余價值賠償，本項目未攤銷完的臨時設施及間接費（比如進出場費，臨時建筑費用等），損失的應得利潤。
國內的具體規定參見合同法和建設工程管理的相關規定，建設工程合同范本，本項目簽訂的合同內容。主要看合同是怎么約定的，在不違反法律明文規定的情況下，合同約定優先。比如合同規定此等情況不能索賠，雖然明顯不合理，但也是有效，損失就由承包商承擔了。